Постпреды стран-членов ЕС в 2016 году решили, что Эстония будет председательствовать в Совете во второй половине 2017 года вместо Великобритании, которая отказалась от председательства в связи с Brexit. Ранее Эстония должна была председательствовать сразу после Великобритании.
Стоит отметить, что в обязанности страны-председателя входит организация заседаний Совета и деятельности рабочих групп: составление повестки дня, руководство заседаниями и встречами, выяснение общих позиций в ходе обсуждений, заключения сделок на переговорах Европейской комиссии и Европейского парламента.