Важливо відзначити, що статті, опубліковані на medRxiv — не проходили фінальне рецензування. Відповідно, дані результати досліджень носять попередній характер.
Деталі
“Ми з’ясували, що відразу декілька штамів коронавірусу, що володіють мутацією N501Y, були завезені на територію США в листопаді 2020 року і наступні місяці. У січні ці різновиди SARS-CoV-2 почали локальне поширення на території як мінімум 30 штатів”, — пишуть дослідники.
В середині грудня влада Великої Британії повідомила про появу восени двох нових штамів SARS-CoV-2 з мутацією N501Y, що володіють підвищеною заразністю в порівнянні з іншими різновидами коронавірусу. Їхній прабатько з’явився на території Вельсу в вересні 2020 року, спочатку рівень його поширеності був вкрай низьким.
Як вважають вчені, в кінці листопада минулого року він набув ще близько 17 мутацій і після цього став швидко поширюватися по Великій Британії, ставши домінуючим штамом коронавірусу до поточного моменту. Спостереження показують, що він поширюється приблизно в 1,7-2 рази швидше, ніж вже існуючі штами SARS-CoV-2, при цьому він вже встиг проникнути в ряд країн Європи та Азії. Крім того, в Бразилії і ПАР були відкриті місцеві штами зі схожим набором мутацій.
Група американських молекулярних біологів під керівництвом Крістіана Андерсена, професора Дослідницького інституту Скріппса в Ла-Хойя (США), отримала перші свідчення того, що британський коронавірус з’явився в США ще восени минулого року. Дослідники вивчили дані, зібрані в Каліфорнії і ряді інших південних регіонів країни фахівцями геномної компанії Helix.
Читайте також: Пандемія: вчені уточнили заразність нових штамів коронавірусу — дослідження
Ці дані допомогли вченим простежити за поширенням британських штамів SARS-CoV-2 завдяки простій закономірності. Як виявили професор Андерсен і його колеги, мутації, присутні в геномі цих різновидів коронавірусу, часто викликають збої в роботі тієї частини РНК-тесту, яка відповідає за розпізнавання S-білка коронавірусу, ключової частини його оболонки, що відповідає за проникнення в клітини, що інфікує.
Подібна особливість британських різновидів SARS-CoV-2 дозволяє відстежувати їхнє поширення і оцінювати їхню частку серед усіх випадків зараження, не розшифровуючи повністю геноми всіх зразків вірусу, зібраних на території тих штатів, де велися спостереження.
Аналізуючи частоту появи подібних збоїв в РНК-тестів, професор Андерсен і його команда виявили, що британські штами SARS-CoV-2 з’явилися відразу в декількох штатах в кінці осені і початку зими (Каліфорнія, Флорида, Джорджія і Техас). Вони почали швидко поширюватися на території трьох десятків штатів у січні, подвоюючи свою частку серед нових випадків зараження приблизно щотижня.
Біологи перевірили ще раз ці дані, розшифрувавши геном двох сотень зразків вірусу, зібраних в листопаді — січні на території Каліфорнії та Флориди. Аналіз їхніх геномів підтвердив початкові висновки вчених і вказав на те, що штами з мутацією N501Y стануть домінувати на території цих штатів і США в цілому в березні — квітні цього року.
Це, як припускають вчені, може викликати ще один великий спалах COVID-19 в США навесні, якщо влада країни не встигне до цього підготуватися. Зокрема, вчені пропонують не тільки прискорити вакцинацію населення, але і посилити спостереження за поширенням нових версій коронавірусу.